Estudio de variabilidad gen?tica en poblaciones de cedro de monta?a (Cedrela montana J.) (Moritz ex Turczaninov) y porot?n (Erithyna edulis Triana ex Michaelli) con marcadores SSR (Simple Sequense Repeats) e ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat).

 

Authors
Santamar?a Ayala, Daniela Cecilia
Format
BachelorThesis
Status
publishedVersion
Description

Proyecto PIC-12-INIAP-001: Desarrollo e innovaci?n biotecnol?gica para la potenciaci?n de rubros agr?colas de importancia en seguridad alimentaria, competitividad exportable y adaptaci?n al cambio
La diversidad de especies forestales en el Ecuador, se ha visto vulnerada, llevando a una reducci?n alarmante de las poblaciones de estas especies. Siendo consideradas de vital importancia especies forestales nativas como: cedro de monta?a (Cedrela montana J. Moritz ex Turcz aninov) y porot?n (Erithryna edulis Triana ex Michaelli), ya que se las ha catalogado seg?n la lista Roja de la UICN como especies En Peligro Cr?tico (CR). Por lo cual, el objetivo de esta investigaci?n fue la realizaci?n en forma indispensable de un estudio de variabilidad gen?tica de estas especies forestales afectadas, en sectores donde habitan como el Valle del Quijos y el Austro. Para posteriormente conocer el estado de diversidad y actuar con estrategias de conservaci?n que mitiguen esta reducci?n de material gen?tico. En el proceso de estandarizaci?n de marcadores moleculares codominantes (4 SSR) para C. montana (163 individuos), y dominantes (6 ISSR) y 9 para E. edulis (161 individuos de cedro y 47 individuos de E. edulis), se ensay? 2 m?todos de extracci?n convencionales (SORBITOL-CTAB, y CTAB), recurriendo a utilizar CTAB por su alto rendimiento al obtener un rango promedio ?ptimo, tanto de pureza como de concentraci?n de ADN, de 1.89 y 1209.32 ng/uL, respectivamente para ambas especies. El genotipaje se llev? a cabo en dos tipos de analizadores Gen?ticos, por un lado para SSR se utiliz? el LI-COR ? 4300S, mientras que para ISSR se emple? el programa Photocapt Molecular Weight Version 10.01. Los resultados obtenidos a partir de las matrices genot?picas generadas por estos programas, recalcan el alto nivel de diversidad que presentan los individuos evaluados de estas especies, as? se obtuvieron altos valores en par?metros de diversidad como heterocigosis (en C. montana Ho= 0.597> He=0.584, con ISSR uH=0.398>H=0.393; en E. edulis uH=0.385>H=0.378) y PIC (C. montana con SSR=0.559; con ISSR=0.308; C. montana ISSR=0.303). Los m?todos de distribuci?n realizados a partir de UPGMA con coeficiente de Jaccard (J), PCoA, y alta correlaci?n geogr?fica entre los individuos, mostraron distribuci?n bastante definida correspondiente en la mayor?a a cada sector analizado. La distribuci?n con mayor diversidad detectada de acuerdo al AMOVA, y estad?sticos G y F, es una distribuci?n intrapoblacional, identificando que 95,05% de la poblaci?n de C. montana y 94,36% de E. edulis, corresponden a esta diversidad. La variabilidad detectada en C. montana con 2 tipos de marcadores marcadores (SSR e ISSR), permiti? obtener m?s informaci?n y robustecer el estudio.

Publication Year
2015
Language
spa
Topic
C. MONTANA
E. EDULIS
SSR
ISSR
PIC
HETEROCIGOSIS
AMOYA
ESTAD?STICOS F Y G
Repository
Repositorio SENESCYT
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http://repositorio.educacionsuperior.gob.ec/handle/28000/4500
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