Análisis de la diversidad genética del capulí (Prunus Serotina), en la región andina del Ecuador, utilizando marcadores moleculares AFLP

 

Authors

Moncayo Contreras, Omar Rodrigo

Format

BachelorThesis

Status

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Description

The Capulí (Prunus serotina) is a tetraploid species of the family Rosaceae, native from North America, but also present in Central America and throughout the Andean alley of South American. The species is widely distributed in the Ecuadorian highlands. Capulí has great ethnobotanic importance in the region, mainly for its fruit, much appreciated by very fond of the inhabitants of the ecuadorian highlands, but also for its timber. A first analysis of genetic diversity and population structure in capulí was carried out by Guadalupe et al. (2015). The main results were the finding of a moderate level of genetic diversity (He = 0.71), and a slight genetic differentiation between subpopulations from the southern provinces (Cañar and Azuay) and those of the center and north of the country. The present research contributed with additional information regarding the level of genetic diversity of the ecuadorian capulí (Prunus serotina) and its population structure. Through the use of AFLP molecular markers, 80 capuli accessions from 8 provinces of the Ecuadorian highlands were characterized molecularly: Carchi, Tulcán, Imbabura, Tungurahua, Cotopaxi, Chimborazo, Cañar and Azuay. Five combinations of AFLP primers were tested, of which three were polymorphic and showed clear and reproducible signals on acrylamide gels. The results of this study reveal a low level of genetic diversity (uHe = 0.284) for capuli, a characteristic finding of non-endemic related species subject to partial domestication events (Xu et al, 2006). Furthermore, population structure analyzes do not show a genetic differentiation by provinces (Nei values: 0.018 to 0.069), so there is no clear evidence of population structure. However, it was shown that the province of Cañar (located furthest south) exhibits a greater genetic differentiation with respect to other provinces analyzed. The use of SSR and AFLP molecular markers, give a first overview of the current state of genetic diversity of P. serotina in Ecuador. Further anthropological, economic and evolutionary information of the species is required, to support the hypotheses develop in both studies.
El capulí (Prunus serotina) es una especie tetraploide de la familia Rosaceae, originaria de Norteamérica, presente también en Centroamérica y el callejón interandino suramericano. La especie está distribuida ampliamente en la sierra ecuatoriana. El capulí tiene una gran importancia etnobotánica en la región, ya que su fruto es muy apetecido por los habitantes de la sierra, así también por su madera. Un primer análisis de diversidad genética y estructura poblacional en capulí fue realizado por Guadalupe y colaboradores (2015). Los principales resultados fueron el hallazgo de un moderado nivel de diversidad genética (He= 0.71), y una sutil diferenciación genética entre las provincias sureñas (Cañar y Azuay) y aquellas del centro-norte. La presente investigación contribuyó con información adicional respecto al nivel de diversidad genética del capulí (Prunus Serotina) y su estructura poblacional. Mediante el uso de marcadores moleculares tipo AFLP, se caracterizó molecularmente 80 accesiones de capulí de 8 provincias de la Sierra ecuatoriana: Carchi, Tulcán, Imbabura, Tungurahua, Cotopaxi, Chimborazo, Cañar y Azuay. Se probó 5 combinaciones de primers AFLP, de los cuales 3 fueron polimórficos y presentaron señales claras y reproducibles en geles de acrilamida. Los resultados de este estudio develan un bajo nivel de diversidad genética (uHe=0.284) para el capulí, hallazgo característico de especies emparentadas no endémicas sujetas a eventos parciales de domesticación (Xu et al, 2006). Los análisis de estructura poblacional no muestran una diferenciación por provincias (valores de Nei: 0.018 a 0.069), por lo que no hay evidencia clara de estructura en la población. Sin embargo, se evidenció que la provincia de Cañar muestra una mayor diferenciación genética con respecto al resto de provincias analizadas. La utilización de los marcadores moleculares SSR y AFLP, dan un primer panorama del estado actual de la diversidad genética de Prunus serotina en el Ecuador. Se requiere información antropológica, económica y evolutiva de la especie, para sustentar las hipótesis planteadas en ambos estudios.

Publication Year

2017

Language

spa

Topic

Capulí
Genética
Biotecnología
CIENCIAS AGROPECUARIAS
FORESTACIÓN

Repository

Repositorio Universidad San Francisco de Quito

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http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/6555

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openAccess

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