Escherichia coli pathotypes from Ecuador association with diarrhea and antibiotic resistance

 

Authors

Montero Toro, Lorena Patricia

Format

MasterThesis

Status

publishedVersion

Description

Diarrheagenic Escherichia coli (DEC) is an important cause of diarrhea in the developing world and the detection of these bacteria and their antibiotic resistance profiles is necessary for effective therapy. In this study, we conducted a microbiological survey of DEC in 233 stool samples, collected during a case control study in a hospital and health center in a low income neighborhood of Quito, Ecuador from April to September 2014. We used 8 sets of PCR primers to detect distinct DEC pathotypes. The overall prevalence of DEC was 30.5% in cases and 20.2% in controls (OR 1.76 CI 95% 0.96-3.20, p=0.06), Diffusely adherent E.coli (DAEC) was the most frequently detected pathotype in cases and controls (15.3% vs. 6.1% respectively) and was the only pathotype with a statistically significant association with diarrhea (OR 2.78, CI 95% 1.11-6.96, p=0.03). To our knowledge this is the first study investigating this pathotype in Ecuador. Additionally, pathotypes isolated from cases exhibited significantly higher levels of antimicrobial resistance to specific antibiotics, as well as higher levels of multidrug resistance, than isolates obtained from controls.
Escherichia coli diarreogénica (DEC) es una importante causa de diarrea en el mundo en desarrollo y la detección de estas bacterias y su perfil de resistencia a los antibióticos es necesario para una efectiva terapia. En este estudio, nosotros conducimos un estudio microbiológico en 233 muestras de heces, colectadas durante un estudio de caso-control en un hospital y centro de salud en un barrio de bajos ingresos de Quito, Ecuador desde Abril hasta Septiembre del 2014. Nosotros usamos 8 sets de primers de PCR para detectar los distintos patotipos de DEC. La prevalencia total de DEC fue de 30.5% en los casos y 20.2% en los controles (OR 1.76 IC 95% 0.96-3.20, p=0.06), E.coli difuso adherente (DAEC) fue el patotipo más frecuentemente aislado en casos y controles (15.3% vs. 6.1% respectivamente) y fue el único patotipo con una asociación estadísticamente significativa con diarrea (OR 2.78, IC 95% 1.11-6.96, p=0.03). Para nuestro conocimiento este es el primer estudio que investiga este patotipo en el Ecuador. Adicionalmente, patotipos aislados de casos exhibieron significativos altos porcentajes de resistencia antimicrobial para específicos antibióticos, así como también altos niveles de multidrogo resistencia, que los aislados obtenidos de controles.

Publication Year

2016

Language

spa

Topic

Escherichia Coli
Diarrea
Microbiología
Resistencia Antibiótica
CIENCIAS
MICROBIOLOGÍA

Repository

Repositorio Universidad San Francisco de Quito

Get full text

http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/5428

Rights

openAccess

License

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/