Protocolo de identificación molecular de especies de tiburón analizando muestras de Galápagos y Puerto López
- Format
- BachelorThesis
- Status
- publishedVersion
- Description
During the past 20 years, there has been the awareness of the decreasing shark populations due to over fishing, natural mortality or, even worse, the demand for shark fins. This issue occurs on a global scale which includes Ecuador, and therefore it makes necessary to obtain specific information that provides the composition and proportion of sharks captured within the country. This information will allow evaluating effects of exploitation and the conservation needs. The aim of this research was to standardize an identification protocol for shark species through molecular methods. For this, DNA was extracted from 102 samples of wet fins/skin found in the ship FER MARY I, which was detained inside the Galapagos Marine Reserve (GMR), and dried fins/skin obtained at Puerto López market. The molecular identification was carried out by PCR reactions with multiple species-specific primers, based on nuclear ribosomal ITS2 in one reaction to produce diagnostic amplicons distinguishing between species simultaneously. The molecular identification results coincided in 99% with the morphological identification that was made previous to the sample collection of fins/skin. As a conclusion, the standardization of the protocol is reliable and useful for the identification of shark species when a morphologic identification is not possible. The results of this study revealed that the relative proportion of captured shark species found in the ship “FER MARY I” in June 2011, and dried fins/skin from Puerto López market in 2012 was: 51,96% Alopias pelagicus, 21,57% Carcharhinus falciformis, 17,65% Prionace glauca, 6,86% Sphyrna zygaena, 0,98% Isurus oxyrinchus y 0,98% Carcharhinus galapagensis. This research establishes a precise molecular identification protocol of six shark species. This tool is useful mainly in the case of shark finning, where morphological identification is difficult. This study provides a basis to contribute with reliable information about the sharks problematic in Ecuador which may be useful to support policies about fishing management and sharks conservation in the country, as well as to assess the sale of shark meat in Ecuadorian markets.
En los últimos 20 años se ha tenido conocimiento de la disminución de poblaciones de tiburones ya sea por sobrepesca, mortalidad natural o, más grave aún, por prácticas de aleteo. Esta problemática sucede a escala global que incluye a Ecuador, haciendo necesario el obtener información específica que permita conocer la composición y la proporción de los tiburones capturados en el país. Esta información permitirá evaluar los efectos de la explotación y las necesidades de conservación. El objetivo de este estudio fue estandarizar un protocolo de identificación de especies de tiburón mediante métodos moleculares. Para esto, se extrajo ADN de 102 muestras de aletas/piel húmedas encontradas en la embarcación FER MARY I, detenida en la Reserva Marina de Galápagos (RMG) y aletas/piel secas obtenidas en el mercado de Puerto López. La identificación molecular fue llevada a cabo mediante reacciones de PCR con múltiples primers especie-específicos basados en regiones ITS2 en una sola reacción para producir amplicones de diagnóstico y diferenciar de forma simultánea entre las especies. Los resultados de identificación molecular coincidieron en 99% con la identificación morfológica realizada previa a la toma de muestras de aletas/piel. Por lo que se puede concluir que la estandarización del protocolo es confiable y útil para identificación de especies de tiburón cuando no es posible la identificación morfológica. Los resultados de este estudio revelaron que la proporción relativa de especies de tiburón capturadas en la embarcación FER MARY I en Junio del 2011 y aletas secas obtenidas en el mercado de Puerto López en el 2012 fue: 51,96% Alopias pelagicus, 21,57% Carcharhinus falciformis, 17,65% Prionace glauca, 6,86% Sphyrna zygaena, 0,98% Isurus oxyrinchus y 0,98% Carcharhinus galapagensis. Esta investigación establece un protocolo preciso de identificación molecular de seis especies de tiburón. Esta herramienta es útil principalmente en el caso de aleteo en el que se dificulta la identificación morfológica. Por lo que este estudio sirve de base para aportar con información confiable sobre la problemática de tiburones en Ecuador y que a su vez será útil para sustentar políticas sobre el manejo de la pesquería y la conservación de tiburones en el país, así como para sincerar la venta de carne de tiburón en los mercados del Ecuador.
- Publication Year
- 2013
- Language
- esp
- Topic
- Biotecnología
Ciencia
- Repository
- Repositorio Universidad San Francisco de Quito
- Get full text
- http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/2228
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/